Настройка поиска в bitrix при включенной мультисайтовости

Сегодня столкнулся с проблемой некорректной работы поиска на сайте под управлением системы bitrix. До включения мультисайтовости — работала только одна версия и все было в порядке. Однако после добавления второго сайта — во-первых переиндексация поиска перестала работать и начала зависать, а во вторых вскрылись некоторые не совсем очевидные сразу особенности.

Повышение эффективности MySQL. Оптимизация SQL запросов

Управление индексами, то есть как они создаются и поддерживаются — может значительно повлиять на производительность sql запросов. Очень часто можно применить следующие оптимизации: удалить неиспользуемые индексы определить неиспользуемые вообще и неэффективные индексы улучшить индексы избегать вообще sql запросов! упрощать sql запросы и магия варианты кеширования